Условие:
№6.Известно, что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельны: 5'-концу в одной цепи соответствует 3'-конец другой цепи. Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5'-конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5'- к 3'-концу. Все виды РНК синтезируются на ДНК-матрице. В цепи нуклеиновых кислот могут иметься специальные комплементарные участки - палиндромы, благодаря которым у молекулы может возникать вторичная структура. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезируется участок центральной петли тРНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов (нижняя цепь - матричная):
5'-АГГТЦААГТТГТГАЦЦТ-3'
3'-ТЦЦАГТТЦААЦАЦТГТА-5'
Установите нуклеотидную последовательность участка тРНК, который синтезируется на этом фрагменте. Найдите на данном участке палиндром и установите вторичную структуру центральной петли тРНК. Определите аминокислоту, которую будет переносить эта тРНК в процессе биосинтеза белка, если антикодон равноудалён от концов палиндрома.
Решение:
Для решения данной задачи, давайте пройдемся по всем шагам.
Шаг 1: Определение последовательности тРНК
Мы знаем, что синтез тРНК происходит на матричной цепи ДНК, которая представлена в 3-5 направлении. Чтобы получить последовательность тРНК, мы должны определить комплементарные нуклеотиды к матричной цепи.
Матрица:
3-ТЦЦАГТТЦААЦАЦТГТА-5
5-АГГТЦААГТТГТГАЦЦТ-3 (некодирующая цепь)
Теперь мы можем записать последовательность тРНК, синтезируемую на матричной цепи, начиная с 5-конца:
- Т (А)
- Ц (Г)
- Ц (Г)
- А (У)
- Г (Ц)
- Т (А)
- Т (А)
- Ц (Г)
- А (У)
- А (У)
- Ц (Г)
- А (У)
- Ц (Г)
- Т (А)
- Г (Ц)
- Т (А)
Таким образом, последовательность тРНК будет:
5-АГГУЦААГУУГУГЦЦУ-3
Шаг 2: Поиск палиндрома
Теперь мы ищем палиндром в полученной последовательности тРНК. Палиндром — это последовательность, которая читается одинаково в обоих направлениях.
В последовательности 5-АГГУЦААГУУГУГЦЦУ-3 мы можем заметить, что:
- Участок ГУУГ является палиндромом, так как он читается одинаково в обе стороны.