1. Главная
  2. Библиотека
  3. Биология
  4. Сколько различных вариантов оптимального выравнивания получится при использовании алгоритма Нидлмана-Вунша для следующих д...

Сколько различных вариантов оптимального выравнивания получится при использовании алгоритма Нидлмана-Вунша для следующих двух последовательностей: A: GGAATGG B: ATG Для расчетов используйте следующую матрицу замен: | | A | G | C | T

«Сколько различных вариантов оптимального выравнивания получится при использовании алгоритма Нидлмана-Вунша для следующих двух последовательностей: A: GGAATGG B: ATG Для расчетов используйте следующую матрицу замен: | | A | G | C | T »
  • Биология

Условие:

Сколько различных вариантов оптимального выравнивания получится при использовании алгоритма Нидлмана-Вунша для следующих двух последовательностей:

A: GGAATGG
B: ATG
Для расчетов используйте следуюицю матрицу замен:
\begin{tabular}{c|c|c|c|c|}
\hline- & A & G & C & T \\
\hline A & 10 & -1 & -3 & -4 \\
\hline G & -1 & 7 & -5 & -3 \\
\hline C & -3 & -5 & 9 & 0 \\
\hline T & -4 & -3 & 0 & 8 \\
\hline
\end{tabular}

Штраф за разрыв: -5

Решение:

Чтобы найти количество различных вариантов оптимального выравнивания двух последовательностей A и B с использованием алгоритма Нидлмана-Вунша, нам нужно выполнить несколько шагов. Давайте начнем. ### Шаг 1: Инициализация матрицы Мы создадим матрицу для выравнивания, где строки будут представлять последовательность A (GGAATGG), а столбцы — последовательность B (ATG). Размер матрицы будет (m+1) x (n+1), где m — длина A, а n — длина B. Длина A = 7, длина B = 3. Таким образом, размер матрицы будет 8 x 4. Инициализируем матрицу: - Заполним первую строку и первый столбец, учитывая штраф за разр...

Похожие задачи

Не нашел нужную задачу?

Воспользуйся поиском

AI помощники

Выбери предмет

E
S
А
Б
В
Г
Д
Е
Ж
З
И
К
Л
М
Н
О
П
Р
С
Т
У
Ф
Х
Ц
Ч
Э
Я