Условие:
Подумайте, какие модификации можно сделать в алгоритме Нидлмана-Вунша, чтобы вместо глобального выравнивания, он осуществлял локальное.
Требуется вывести максимальное значение функции оценки схожести.
А теперь все то же самое, но вывести само выравнивание схожих участков.
При выводе выровненные участки выводятся так же, как и при глобальном выравнивании. Невыровненые "хвосты" пишутся вплотную к выворненным участкам в нижнем регистре.

