Давайте разберем каждое предложение по порядку, расставим знаки препинания, составим схемы и объясним, почему мы ставим те или иные знаки.
1. Здесь всё было чрезвычайно уютное и несколько миниатюрное: небольшие шёлковые кресла, низенькие пуфы, качалка, крошечная ...
Здесь всё было (чрезвычайно уютное и несколько миниатюрное): (небольшие шёлковые кресла, низенькие пуфы, качалка, крошечная полка с произведениями поэтов).
- Двоеточие ставится перед перечислением, которое объясняет, что именно было уютным и миниатюрным.
- Запятые ставятся для разделения однородных членов предложения (кресла, пуфы, качалка, полка).
---
От дома, от деревьев, от голубятни и от галереи (от всего) побежали далеко (длинные тени).
- Запятые ставятся для разделения однородных членов предложения (дома, деревьев, голубятни).
- И соединяет последний элемент в перечислении, поэтому запятая перед и не ставится.
---
Он (стоял, читал, слушал, отвечал, сам даже спрашивал), но (всё это машинально).
- Запятые ставятся для разделения однородных членов (стоял, читал, слушал, отвечал, спрашивал).
- Запятая перед но отделяет две части сложносочиненного предложения.
---
Произведения (прославленных русских художников Рокотова, Кипренского, Тропинина и других) украшают (многие залы музея Пушкина).
- Запятые ставятся для выделения однородных членов предложения (Рокотова, Кипренского, Тропинина).
- И соединяет последний элемент в перечислении, поэтому запятая перед и не ставится.
---
Собранная здесь (уникальная коллекция лекарственных трав) известна (сейчас не только отечественным, но и зарубежным специалистам).
- Запятая ставится перед но в сложносочиненном предложении, чтобы отделить части, которые противопоставляются (отечественным и зарубежным специалистам).
---
Таким образом, мы расставили знаки препинания, составили схемы и объяснили их постановку для каждого предложения.