Исходная последовательность: Прочтения (l=4, k=7): шласашапо_шоссе шла_саш ла_саша асаша сашап саша_по ашапо шапош апошо пошос по_шосс о_шоссе Построить граф перекрытий и получить контиги

В данном контексте, задача, по всей видимости, связана с построением графа де Брёйна или графа перекрытий (overlap graph) для набора $l$-меров (или $k$-меров с перекрытием) из исходной строки.

Давайте определим входные данные и цель.

1. Дано

1. Исходная строка (текст): S = \text{"шла_саша_по_шоссе"}
2. Длина слова (фрагмента): $l = 4$
3. Длина перекрытия: $k = 7$

Критическое замечание по параметрам: Обычно в задачах на графы перекрытий или де Брёйна используются параметры:

• $k$: длина $k$-мера (для графа де Брёйна).
• Или $k$: длина перекрытия, где дли...